Το εμβληματικό μνημείο του νησιού, ο Λυκιακός Τάφος, βρίσκεται στα ανατολικά του λιμανιού. Ο λυκιακός τάφος συμβολίζει ουσιαστικά τις σχέσεις του νησιού με τα μικρασιατικά παράλια, και συγκεκριμένα με τους κατοίκους της περιοχής Λυκίας, όπου οι κάτοικοι λάτρευαν τον Λύκιο Απόλλωνα ως λύκο. Χρονολογείται στον 4ο π.Χ. αιώνα και είναι θαλαμοειδής, με αρχιτεκτονικά διαμορφωμένη πρόσοψη σε κόγχη λαξευμένη στο βράχο. Η θύρα είναι διακοσμημένη με τριπλή ταινία και στο εσωτερικό του υπάρχουν νεκρικές κλίνες στις 3 πλευρές, διατεταγμένες σε 2 επίπεδα.

Το αρχαιότερο και σημαντικότερο μνημείο του νησιού, το Παλαιόκαστρο, βρίσκεται στη δυτική πλευρά του Καστελόριζου, σε απόσταση ενός περίπου χιλιομέτρου από την πρωτεύουσα. Πρόκειται για την αρχαία ακρόπολη του νησιού που χτίστηκε γύρω στον 3ο αιώνα π..Χ και χρησιμοποιήθηκε μέχρι και την περίοδο της Ιταλοκρατίας. Εντός της υπήρχε οικισμός με σπίτια, δεξαμενές και εκκλησίες της μεσοβυζαντινής περιόδου, από τις οποίες οι δύο καταστράφηκαν κατά τη διάρκεια του Α’ Παγκοσμίου Πολέμου.

Το Κάστρο των Ιπποτών του Αγίου Ιωάννη γνωστό και ως Κάστρο της Μεγίστης, δεσπόζει πάνω από τον οικισμό, στην κορυφή του Καστέλο Ρόσο, του κόκκινου βράχου απ’ όπου πήρε το όνομά του το νησί. Τον 14ο αιώνα, όταν οι Ιωαννίτες Ιππότες κατέλαβαν το νησί, έχτισαν το κάστρο αυτό, χρησιμοποιώντας υλικά από την αρχαία ακρόπολη. Σήμερα από το κάστρο σώζονται μόνο ερείπια του εσωτερικού του και τα τείχη του, ωστόσο μία επίσκεψη εκεί προσφέρει μία υπέροχη θέα στο λιμάνι του νησιού αλλά και στα μικρασιατικά παράλια.

Τετρακόσια ένα σκαλιά χωρίζουν το λιμάνι του νησιού από τον Άγιο Γεώργιο του Βουνού, ένα εγκαταλελειμμένο μοναστήρι που θυμίζει κάστρο. Η μονή του Αγίου Γεωργίου του Βουνού περιβάλλεται από τεράστιες φυσικές πλάκες που αποτελούν τον περίβολο της, ο οποίος περιλαμβάνει τα ερειπωμένα πλέον κελιά των μοναχών και βοηθητικούς χώρους.

Η Σάμος είναι ένα μεγάλο νησί με πάρα πολλές παραλίες. Ενδεικτικά αναφέρουμε κάποιες: Η παραλία Κοκκάρι βρίσκεται 9 χμ. βορειοδυτικά από την πρωτεύουσα. Είναι βοτσαλωτή και τα νερά της είναι βαθιά. Προσοχή όταν φυσάει γιατί σηκώνει τεράστια κύμματα. Στην περιοχή του Μαραθόκαμπου βρίσκεται η παραλία Βοτσαλάκια. Έχει μήκος 3 χμ και η πρόσβαση με το αμάξι είναι εύκολη. Λίγο πιο πέρα από την παραλία Βοτσαλάκια θα συναντήσετε την παραλία του Αγίου Ιωάννη του Ελεήμονα. Η παραλία είναι τελείως ερημική και θα φτάσετε εκεί ακολουθώντας τις πινακίδες που οδηγούν στο Παλαιοχώρι.

Η Σάμος είναι ένα νησί με πολλούς υδροβιότοπους οι οποίοι φιλοξενούν διάφορα πουλιά που έρχονται για να βρουν τροφή, να αναπαραχθούν και να κρυφτούν από τους φυσικούς τους εχθρούς.

Οκτώ χιλιόμετρα έξω από το Πυθαγόρειο βρίσκεται ο αρχαιολογικός χώρος του Ηραίου, ίσως του μεγαλύτερου ναού στην Ελλάδα. Ο ναός ήταν αφιερωμένος στη λατρεία της θεάς Ήρας, συζύγου του Δία.

Το Πυθαγόρειο είναι χτισμένο πάνω στα ερείπια της αρχαίας πόλης της Σάμου και πιο συγκεκριμένα στη θέση που βρισκόταν το αρχαίο λιμάνι που κατασκεύασε ο Πολυκράτης. Το Πυθαγόρειο αποτελείται από τρεις οικισμούς: τον Καρπόβολο με 23 κατοίκους, τη Νέα Πόλη με 211 και τους Πούντες με 81. Το Πυθαγόρειο είναι το λιμάνι απόπλου για πλοιάρια που εκτελούν δρομολόγια προς στα παράλια της Μικράς Ασίας και τις αρχαίες πόλεις της Ιωνίας. Ημερήσιες εκδρομές με καϊκια ξεκινούν καθημερινά προς τις πανέμορφες παραλίες της Σαμιωπούλας, Τσόπελα, Κακό Ρέμα, Κυριακού, Ασπρος Κάβος κ.α.

Το Αρχαιολογικό Μουσείο Σάμου βρίσκεται στην πρωτεύουσα του νησιού, το Βαθύ, και στεγάζεται σε δύο κτίρια στο κέντρο της πόλης. Το ένα κτίριο είναι το "Πασχάλειον αρχαιοφυλάκειον", το παλιό μουσείο του 1912 και το άλλο κτίριο είναι αυτό του "Νέου Μουσείου" που κτίστηκε με δαπάνες γνωστής αυτοκινητοβιομηχανίας και εγκαινιάστηκε τη δεκαετία του 1980.