Το Λαογραφικό Μουσείο της Σάμου ιδρύθηκε από το Πνευματικό Ίδρυμα Νικολάου Δημητρίου το 1997. Βρίσκεται στην περιοχή του Πυθαγόρειου και ιδρύθηκε για να δώσει στους επισκέπτες μια ολοκληρωμένη εικόνα της καθημερινότητας των κατοίκων του νησιού ως το 1940.
Μουσεία
Το μουσείο Φυσικής Ιστορίας Αιγαίου βρίσκεται στην κοινότητα των Μυτιληνιών, σε κτίριο που έχει ανεγερθεί με δαπάνες του Ιδρύματος Κωνσταντίνου και Μαρίας Ζημάλη καθώς και του ευρωπαϊκού προγράμματος Leader. Στο μουσείο φιλοξενείται από το 1994 και η συλλογή του Παλαιοντολογικού Μουσείου που λειτουργούσε από το 1967.
Το Αρχαιολογικό Μουσείο της Αμοργού βρίσκεται στη Χώρα και στεγάζεται στον Πύργο του Γαβρά, ένα κτίσμα βενετσιάνικης αρχικτεκτονικής, που ανάγεται στον 16ο αιώνα. Άνοιξε τις πύλες του στο κοινό το 1963, για να στεγάζει ευρήματα των τριών αρχαίων πόλεων της Αμοργού (Αιγιάλη, Αρκεσίνη και Μινώα), χρονολογούμενα από τα προϊστορικά χρόνια, έως και τη Ρωμαϊκή εποχή, το 2ο αιώνα μ.Χ.
Το Αρχαιολογικό Μουσείο Νισύρου είναι ένα νέο σχετικά μουσείο και βρίσκεται σε κεντρικό δρόμο στην πρωτεύουσα του νησιού, το Μανδράκι. Το κτίριο στο οποίο στεγάζεται κτίστηκε με δαπάνες των αδελφών Γιαννίδη και παραχωρήθηκε στο Υπουργείο Πολιτισμού το 2001. Προς το παρόν στο μουσείο δημιουργούνται εργασίες επέκτασης του υπόγειου χώρου και του ισογείου, ενώ προβλέπεται και η κατασκευή δύο στεγάστρων στον αύλειο χώρο του μουσείου για τα μαρμάρινα μέλη που εκτίθενται εκεί.
Το Ιστορικό και Λαογραφικό Μουσείο Νισύρου στεγάζεται σε ένα διώροφο αρχοντικό του 18ου αιώνα που έχει αποκατασταθεί από το Δήμο, στα σκαλιά προς την Μονή της Παναγίας Σπηλιανής στο Μανδράκι. Οι χώροι του μουσείου είναι έτσι διαμορφωμένοι ώστε να περιλαμβάνουν όλα τα δωμάτια ενός παραδοσιακού Νισύριου σπιτιού, όπως την κουζίνα, τον φούρνο και την κρεβατοκάμαρα (τη λεγόμενη “μονή”).
Το Ηφαιστειολογικό Μουσείο Νισύρου εγκαινιάστηκε το 2008 και είναι το πρώτο Ηφαιστειολογικό Μουσείο της χώρας. Δημιουργήθηκε από το Δήμο Νισύρου σε συνεργασία με το ΑΠΘ, το ΙΓΜΕ και το Υπουργείο Αιγαίου. Βρίσκεται στο χωριό Νικιά και είναι ανοιχτό όλο το χρόνο. Στεγάζεται σε ένα παλιό εγκαταλελειμένο σχολείο το οποίο αναδιαμορφώθηκε για τις ανάγκες του μουσείου. Είναι υπερσύγχρονο και διαθέτει τόσο αίθουσες έκθεσης των πετρωμάτων και λοιπών ευρημάτων όσο και αίθουσες εκδηλώσεων.
Το Αρχαιολογικό Μουσείο Αστυπάλαιας είναι ένα σχετικά νέο μουσείο, αφού εγκαινιάστηκε μόλις τον Σεπτέμβριο του 1998. Βρίσκεται στη Χώρα της Αστυπάλαιας, και συγκεκριμένα στον Πέρα Γιαλό. Στο μουσείο εκτίθενται ευρήματα που καλύπτουν ευρύ χρονολογικό φάσμα, από την προϊστορική εποχή ως τα χρόνια του Μεσαίωνα. Στο μουσείο υπάρχει πληθώρα αγγείων, κοσμημάτων, εργαλείων και λοιπών αντικειμένων τα οποία βρέθηκαν σε πλούσιους θαλαμωτούς τάφους της Μυκηναϊκής εποχής στις περιοχές Αρμενοχώρι και Σύγκαιρο.
Το Λαογραφικό Μουσείο Σαμοθράκης είναι ένα νέο σχετικά μουσείο που ιδρύθηκε με πρωτοβουλία του Δήμου και του Πολιτιστικού Συλλόγου του νησιού και βρίσκεται στη Χώρα. Στο μουσείο φιλοξενούνται διάφορα αντικείμενα που συνθέτουν την πολιτιστική κληρονομιά του νησιού.
Το αρχαιολογικό μουσείο της Σαμοθράκης βρίσκεται στην Παλαιόπολη. Συντηρείται με έξοδα του Ελληνικού κράτους και στεγάζει όσα τοπικά ευρήματα έχουν απομείνει στο νησί. Τα πιο πολλά ευρήματα τα βρήκαν Αμερικάνοι αρχαιολόγοι, ενώ πολλά ευρήματα βρήκαν τυχαία κάτοικοι του νησιού. Πολλά επίσης, ευρήματα, είναι από την προσωπική συλλογή του Νικολάου Φαρδύ, γνωστού πνευματικού ανθρώπου του νησιού.
Τα δύο πιο γνωστά μουσεία της Ζακύνθου είναι το Μουσείο Βυζαντινής και Μεταβυζαντινής Τέχνης και το Μουσείο Σολωμού και Κάλβου, τα οποία βρίσκονται στη πόλη της Ζακύνθου, την πρωτεύουσα του νησιού. Στο πρώτο μπορεί να θαυμάσει κανείς εκθέματα του 12ου - 18ου αιώνα μ.Χ καθώς και πολλές Αγιογραφίες. Στο Μουσείο Σολωμού και Κάλβου ο επισκέπτης θα δει πολλά χειρόγραφα αλλά και προσωπικά αντικείμενα των δύο αυτών σπουδαίων προσωπικοτήτων αλλά και πολλών άλλων σπουδαίων Ζακυνθινών. Επτά χιλιόμετρα βορειοανατολικά της Ζακύνθου, στο Τσιλιβί, βρίσκεται το Μιλάνειο Ναυτικό Μουσείο.