Στην Ερμούπολη βρίσκεται ένα από τα πιο παλιά αρχαιολογικά μουσεία της Ελλάδας. Το Αρχαιολογικό Μουσείο Σύρου που ιδρύθηκε το 1834 και στεγάζεται στο χώρο του Δημαρχείου. Ενώ πρόκειται για ένα σημαντικό μνημείο της πόλης, που σχεδιάστηκε από τον διάσημο Ενρστ Τσίλλερ
Ο Ερνέστος Τσίλλερ, παρότι είχε γερμανική καταγωγή, υπήρξε ένας από τους σημαντικότερους αρχιτέκτονες της ελληνικής επικράτειας. Σχεδίασε εκατοντάδες δημόσια και ιδιωτικά κτήρια και άφησε τη σφραγίδα του στην οικιστική φυσιογνωμία του ελληνικού αστικού χώρου από τα τέλη του 19ου έως τις αρχές του 20ού αιώνα.
Το Αρχαιολογικό Μουσείο Σύρου ιδρύθηκε αρχικά ως κεντρικό νομαρχιακό μουσείο των Κυκλάδων, επειδή η Ερμούπολη είναι η πρωτεύουσα του νομού και περιελάμβανε εκθέματα από όλα τα νησιά των Κυκλάδων. Ενώ αργότερα με την ίδρυση τοπικών μουσείων και σε άλλα νησιά, τα εκθέματα του μουσείου περιορίστηκαν μόνο σε ευρήματα προερχόμενα από τη Σύρο και ελάχιστα από την Αμοργό και την Κύθνο.
Η σημαντικότερη συλλογή του Αρχαιολογικού Μουσείου Σύρου αποτελείται από ευρήματα προερχόμενα από τον οικισμό της Χαλανδριανής, που χρονολογούνται την 3η χιλιετία π.Χ.
Πολύ σημαντικά είναι επίσης και τα εκθέματα από τους 600 τάφους μεγάλης επιστημονικής και ιστορικής αξίας που βρέθηκαν στην ίδια περιοχή και χρονολογούνται στην ελληνιστική εποχή.
Στο μουσείο παρουσιάζονται επίσης μερικά τυχαία ευρήματα από τη Σύρο, αρκετές επιτύμβιες στήλες και αρκετά γλυπτά, μεταξύ άλλων και ένα αιγυπτιακό αγαλματίδιο από μαύρο γρανίτη που έχει δωριθεί στο μουσείο και αναπαριστά τον αρχιερέα Ανχάπη.
