Το μουσείο ιδρύθηκε το 1979 από το ίδρυμα Γουλανδρή, καθώς η Άνδρος είναι η γενέτειρα του Βασίλη Γουλανδρή. Αρχικά στο μουσείο εκθέτονταν έργα του ανδριώτη καλλιτέχνη Μιχάλη Τόμπρου, και έργα από την προσωπική συλλογή του Βασίλη και Ελίζας Γουλανδρή. Το 1986 λόγω μεγάλου ενδιαφέροντος δημιουργήθηκε και νέα πτέρυγα στην οποία παρουσιάζονται περιοδικές εκθέσεις έργων κάποιου σημαντικού καλλιτέχνη ή έργα κάποιας σημαντικής περιόδου της τέχνης.
Το μουσείο είναι ανοιχτό από 1η Νοεμβρίου έως 31 Μαρτίου, Σάββατο, Κυριακή και Δευτέρα 10:00-14:00, ενώ από 1η Απριλίου-31 Οκτωβρίου είναι ανοικτό καθημερινά (εκτός Τρίτης) 10:00-14:00. Κατά τη θερινή περίοδο (Ιούλιο-Σεπτέμβριο) το πρόγραμμα διαμορφώνεται ως εξής: Τετάρτη-Κυριακή 11:00-15:00 και 18:00-21:00, Δευτέρα 11:00-15:00, Τρίτη κλειστά.