Ακριβώς απέναντι από το Μουσείο Ιστορίας της Τέχνης, με την πλατεία Maria-Theresien να παρεμβάλλεται, βρίσκεται ένα άλλο εντυπωσιακό μουσείο που άνοιξε το ίδιο έτος, το 1889. Το Μουσείο Ιστορίας της Φύσης, που συντομογραφικά λέγετε NHMW (Naturhistorisches Museum Wien).
Στις 39 αίθουσες του το μουσείο προβάλει, διάσημα και αναντικατάστατα εκθέματα όπως το 25.000 ετών αγαλματίδιο που ονομάστηκε Αφροδίτη του Willendorf και δείγματα ζώων ή φυτών που έχουν εξαφανιστεί εκατομμύρια χρόνια πριν. Το πλέον εντυπωσιακό έκθεμα μάλλον είναι ένας σκελετός ενός δεινοσαύρου Diplodocus. Στα αρνητικά, το γεγονός ότι τα εκθέματα έχουν εξηγήσεις μόνο στα Γερμανικά.