Η ίδρυση του Μουσείου φυσικής ιστορίας της Νάντης ανάγεται στο μακρινό 1799. Τότε ο φυσιοδίφης και φαρμακοποιός François-René Dubuisson δημιούργησε το αρχικό τμήμα του, με σκοπό να βοηθήσει την εκπαίδευση νέων επιστημόνων.
Μέσα στα χρόνια το μουσείο άλλαξε οικοδομήματα, επεκτάθηκε και ανακαινίστηκε, ενώ σήμερα φιλοξενεί σημαντικές συλλογές πανίδας, χλωρίδας, γεωλογίας, ορυκτολογίας και παλαιοντολογίας.
