Ο καθεδρικός ναός, όπου ο Πάπας εδρεύει ως Επίσκοπος της Ρώμης, είναι η βασιλική του Αγίου Ιωάννη στο Λατεράνο. Είναι η παλαιότερη από τις τέσσερις μεγάλες βασιλικές της πόλης. Η γη όπου χτίστηκε ο ναός ανήκε πριν στην οικογένεια Λατεράνι.
Ο ναός που βλέπουμε σήμερα χρονολογείται πίσω στο 1646 όταν ο Πάπας Ιννοκέντιος ο Κ΄ ανέθεσε στον αρχιτέκτονα Φραντσέσκο Μπορομίνι (Francesco Borromini) να αποκατασταθεί η βασιλική που ήταν έτοιμη να καταρρεύσει. Η σημερινή νότια πρόσοψη του προστέθηκε αργότερα και σχεδιάστηκε κατά τον 18ο αιώνα από τον Αλεσάντρο Γκαλιλέι (Alessandro Galilei).
Στο διπλανό παλάτι του Λατερανού ήταν η επίσημη κατοικία του Πάπα μέχρι να μετακινηθεί στην Αβινιόν το 1309. Όταν μεταφέρθηκε πίσω στη Ρώμη εγκαταστάθηκε στο Βατικανό, αντί στο παλάτι του Λατερανού. Η εκκλησία ωστόσο παρέμεινε ο κύριος καθεδρικός ναός της Ρώμης. Όταν ο Μπορομίνι ανέλαβε να αποκαταστήσει την εκκλησία, ο σχεδιασμός που έδωσε στη βασιλική ήταν περισσότερο μπαρόκ, ο οποίος ήταν σε πλήρη αντίθεση με αυτόν της παλιάς βασιλικής.
Η ανατολική πρόσοψη του Αγίου Ιωάννη είναι ίσως το πιο αναγνωρίσιμο μέρος του. Χρησιμοποιείται σε αρκετές ταινίες, όπως στο «Διακοπές στη Ρώμη». Αυτή η πρόσοψη συμπληρώνεται με τα μεγάλα αγάλματα του Ιησού και των αποστόλων του από λευκή πέτρα. Οι αρχαίες χάλκινες πόρτες πάρθηκαν από τη Curia στο Forum Romanum.
Παρά τις δραστικές ανακαινίσεις, συνεχίζουν να υπάρχουν ορισμένες ιστορικές τοιχογραφίες όπως είναι ένα κομμάτι μιας τοιχογραφίας του 14ου αιώνα που απεικονίζει τον Πάπα Βονιφάτιο τον Η΄. Υπάρχει επίσης ένα ξύλινο τραπέζι στο παπικό βωμό που λέγεται ότι είχε χρησιμοποιηθεί από τον Άγιο Πέτρο για να γιορτάσει την Ευχαριστία. Το γοτθικό αρτοφόριο, που χρονολογείται από το 1367, έχει μια μακάβρια χρήση καθώς περιέχει υποτίθεται τις κεφαλές των Αγίων Πέτρου και Παύλου.
Στις δώδεκα κόγχες που σχεδίασε ο Μπορομίνι βρίσκονται τα τεράστια αγάλματα των δώδεκα αποστόλων που δημιουργήθηκαν από επιφανείς καλλιτέχνες σε στυλ ροκοκό συμπεριλαμβανομένων του Φραντζεσκο Μοράτι (Francesco Moratti), Αντζελο ντε Ροσι (Angelo de’ Rossi) και του Πιερ Λε Γκρος του νεότερου (Pierre Le Gros the Younger).
Υπάρχουν επίσης έξι παπικοί τάφοι μέσα στον Άγιο Ιωάννη. Περιέχουν τα λείψανα του Αλεξάνδρου Γ΄, του Σέργιου Δ΄, του Κλήμη Η΄, του Μαρτίνου Ε΄, του Ιννοκέντιου Γ΄ και του Λεόντιου του Η΄. Μετά τον Λεόντιο Η΄, οι πάπες θάφτηκαν στον ναό του Αγίου Πέτρου. Μια επίσκεψη στην ξεχωριστή λαύρα του ναού είναι επίσης απαραίτητη για να θαυμάσετε τις μοναδικές στήλες και ψηφιδωτά που βρέθηκαν εκεί. Σημειώστε όμως ότι υπάρχει μια μικρή χρέωση για την είσοδο.
Επίσης, είναι ξεχωριστό το βαπτιστήριο της βασιλικής, που ιδρύθηκε από τον Κωνσταντίνο Α ' το 315 μ.Χ. και ήταν το πρώτο βαπτιστήριο στη Ρώμη.